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80年代初期，錢學森突破中共無神論的框架，提出用「人體功能態」理論來描述人體這一開放的複雜巨系統。並建議把人體科學作為第三個新的科學技術門類。同時他促動當時的中共總書記胡耀邦轉變對氣功的政策決策。

1999年7月後，江澤民在中國下令鎮壓法輪功，鑒於錢學森的威望，江澤民曾數次登門請求錢學森對鎮壓法輪功表態，但這一次，錢學森再沒有對中共的政治運動給予配合，因為氣功確實讓這位老科學家看到了揭示自然和宇宙奧秘的線索，從此錢學森所倡導人體科學的思想被徹底封殺。這次沉默，是錢學森以一名真正的科學家的求實精神所做的表態。